日本一本二本三本的区别在于入取批次、学费上的不同。除此以外，一二三本的办学范畴略微有差异。一本是公办范畴，二本多数是公办范畴，三本一般为民办范畴。事实上123本都是本科院校，学制为4年，毕业后都能获得国家承认的学历。
两者区别：
录取批次不同。按照高考成绩分为第一批次，对应一本院校。第二批次，对应二本院校。第三批次，对应三本院校。事实上，123本都是本科院校，学制为4年，毕业后都能获得国家承认的学历。因此，报考志愿的时候，不必过多纠结。
含金量是生源质量、知名度、认可度、师资、软硬件、学风等各种因素的综合，也属于若干年来约定俗成的民间判断，比如燕山大学是一本，华北理工大学是二本，都是本科，但是即便抛开录取批次的概念，大家也都知道前者比后者明显好。
学费不同。一本最便宜，其次是二本、三本。不过具体的情况还要具体分析。有的二本民办院校就比三本的院校学费要贵。
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